علی لاریجانی، که در نخستین نشست تخصصی تاریخ مجلس سخن می‌گفت، با انتقاد شدید از برخی اظهارنظرها در مورد مصوبه‌ روز یکشنبه گذشته مجلس در مورد ساماندهی دانشگاه‌ها و موسسات عالی غیرانتفاعی و غیردولتی، تصریح کرد: «در مورد مناقشه اخیر عده‌ای بحث را داغ کردند.» وی افزود: «معتقدم افرادی که در این‌باره سر و صدا می‌کنند کل مصوبه را نخوانده‌اند؛ چرا که این مصوبه در مورد تمام موسسات غیرانتفاعی و غیردولتی است که البته بخشی از آن نیز مربوط به دانشگاه آزاد اسلامی است.» لاریجانی اضافه کرد: «‌من خود در مورد اینکه این مصوبه شامل دانشگاه آزاد اسلامی باشد، اشکال قانون اساسی گرفتم؛ اما باید توجه کرد این مصوبه در مورد تمام موسسات غیرانتفاعی و غیردولتی است.»
رئیس مجلس با یادآوری این نکته که «خود مجلس نیز تابع نظامات قانونی است» با اظهار تعجب از خواست عده‌ای که به عقیده وی «می‌خواهند مجلس بدون قانون اداره شود»، گفت: «اداره مجلس براساس آیین‌نامه است.
در مورد این مصوبه نیز به‌خاطر اینکه شورای عالی انقلاب فرهنگی در مورد مساله دانشگاه آزاد اسلامی ورود پیدا کرده است، اخطار را وارد دانستم؛ اما این به معنای خارج کردن کار از دستور نیست.»رئیس قوه مقننه در ادامه با دفاع از جایگاه مجلس، اظهارات برخی افراد که به گفته وی «در رسانه‌ها در مورد مجلس با دریدگی صحبت می‌کنند» دلیل منطقی‌بودن صحبت آنها ندانست.

وی افزود: «همین مجلس وقتی در مورد برخی کشورها موضع می‌گرفت، شما هورا می‌کشیدید، حالا به دلیل اینکه مصوبه‌اش ناخوشایند شماست از صدر تا ذیل آن را به آتش می‌کشید.» وی تصریح کرد: «کسی که به قوه مقننه توهین می‌کند درواقع به ملت توهین می‌کند و شاید این مساله از آنجا ناشی می‌شود که آنقدر ذوب در قوه‌ای هستند که چشم دیدن قوه دیگر را ندارند. نهادهای قانونی کشور باید در جایگاه خود دیده شوند.»
عضو شورای‌عالی امنیت ملی در ادامه با اشاره به اینکه «پس از انقلاب، نگاه ویژه‌ای را به مجلس شاهد بودیم» اضافه کرد: «امام توجه ویژه‌ای به مجلس داشت و شأن برای آن قائل بود و همواره آن را حمایت می‌کرد که بیان ایشان مبنی‌بر اینکه مجلس در راس امور است حرف بسیار مهمی است که در این راستا قرار دارد.»
وی در ادامه با طرح این پرسش که «آیا این رفتار امام تاکتیکی بود یا خیر؟» گفت: «سوال این است که آیا امام با توجه به وضعیت قوه مجریه در دهه 60 این مطلب را بیان کردند تا بار اصلی را روی مجلس بگذارند؟، در جواب باید گفت اینگونه نبوده است؛ امام نگاه نافذی به ملت و حرکت آنها داشتند و صیانت از حقوق مردم و استقلال کشور را در «مجلس مستقل» می‌دانستند. این نگاه، نگاهی استراتژیک و نه تاکتیکی بود.» به گفته لاریجانی، همه رهبران صدر انقلاب این مساله را مورد توجه قرار داده و معتقد بودند مجلس رکنی است که اگر شکل نمی‌گرفت دموکراسی در کشور پا نمی‌گرفت و لذا می‌خواستند هرچه زودتر مجلس را تشکیل دهند. افراد برای تسهیل امور برای مجلس خط و نشان می‌کشند و گاهی این قوانین را دوست ندارند؛ این مساله درست نیست. تفکیک قوا برای کنترل قدرت است، روشن است که قوه مجریه و قضاییه به‌صورت بالفعل دارای قدرتی هستند که اگر کنترل نشوند ممکن است کارهایی به دور از چشم مردم اتفاق افتد.»
وی با یادآوری «اشتباه استراتژیک‌خواندن انحلال مجلس هفدهم از سوی مصدق» گفت: «انحلال مجلس کلید دیکتاتوری است.»